Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHQ9

Pabpc4, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4Q6PHQ9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpc4Q6PHQ9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpc4Q6PHQ9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms