Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc57Q6PHN1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc57Q6PHN1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms