Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nup98Q6PFD9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nup98Q6PFD9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nup98Q6PFD9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms