Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtifQ6PEE2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CtifQ6PEE2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtifQ6PEE2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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