Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SvoplQ6PDF3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
SvoplQ6PDF3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SvoplQ6PDF3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SvoplQ6PDF3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SvoplQ6PDF3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SvoplQ6PDF3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SvoplQ6PDF3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SvoplQ6PDF3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SvoplQ6PDF3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SvoplQ6PDF3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SvoplQ6PDF3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SvoplQ6PDF3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SvoplQ6PDF3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SvoplQ6PDF3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SvoplQ6PDF3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SvoplQ6PDF3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SvoplQ6PDF3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SvoplQ6PDF3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SvoplQ6PDF3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SvoplQ6PDF3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms