Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mfsd13aQ6PDE8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mfsd13aQ6PDE8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mfsd13aQ6PDE8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mfsd13aQ6PDE8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mfsd13aQ6PDE8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mfsd13aQ6PDE8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mfsd13aQ6PDE8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms