Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB51

Ccdc117, Coiled-coil domain-containing protein 117, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc117Q6PB51 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc117Q6PB51 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc117Q6PB51 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc117Q6PB51 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms