Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prkab2Q6PAM0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prkab2Q6PAM0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prkab2Q6PAM0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prkab2Q6PAM0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prkab2Q6PAM0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prkab2Q6PAM0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prkab2Q6PAM0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prkab2Q6PAM0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prkab2Q6PAM0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prkab2Q6PAM0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Prkab2Q6PAM0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prkab2Q6PAM0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prkab2Q6PAM0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prkab2Q6PAM0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prkab2Q6PAM0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prkab2Q6PAM0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prkab2Q6PAM0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prkab2Q6PAM0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Prkab2Q6PAM0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Prkab2Q6PAM0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prkab2Q6PAM0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prkab2Q6PAM0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Prkab2Q6PAM0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Prkab2Q6PAM0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prkab2Q6PAM0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prkab2Q6PAM0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms