Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trak2Q6P9N8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trak2Q6P9N8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak2Q6P9N8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms