Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9K9

Nrxn3, Neurexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn3Q6P9K9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nrxn3Q6P9K9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nrxn3Q6P9K9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nrxn3Q6P9K9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms