Protein–RNA interactions for Protein: Q6P542

Abcf1, ATP-binding cassette sub-family F member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf1Q6P542 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcf1Q6P542 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcf1Q6P542 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcf1Q6P542 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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