Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sik3Q6P4S6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sik3Q6P4S6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sik3Q6P4S6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms