Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Frg2f1Q6P3A2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Frg2f1Q6P3A2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms