Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2K6

Ppp4r3a, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3aQ6P2K6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp4r3aQ6P2K6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppp4r3aQ6P2K6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppp4r3aQ6P2K6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms