Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Paxip1Q6NZQ4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Paxip1Q6NZQ4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Paxip1Q6NZQ4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Paxip1Q6NZQ4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Paxip1Q6NZQ4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Paxip1Q6NZQ4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Paxip1Q6NZQ4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Paxip1Q6NZQ4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Paxip1Q6NZQ4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Paxip1Q6NZQ4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Paxip1Q6NZQ4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Paxip1Q6NZQ4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Paxip1Q6NZQ4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Paxip1Q6NZQ4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Paxip1Q6NZQ4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.9 ms