Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac4Q6NZM9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac4Q6NZM9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac4Q6NZM9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac4Q6NZM9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms