Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Colgalt2Q6NVG7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Colgalt2Q6NVG7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms