Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
2810408A11RikQ6NSU2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
2810408A11RikQ6NSU2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2810408A11RikQ6NSU2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms