Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc66Q6NS45 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc66Q6NS45 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms