Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm4Q6IRU2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm4Q6IRU2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tpm4Q6IRU2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms