Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Best3Q6H1V1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Best3Q6H1V1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Best3Q6H1V1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
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