Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Edrf1Q6GQV7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Edrf1Q6GQV7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Edrf1Q6GQV7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Edrf1Q6GQV7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Edrf1Q6GQV7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Edrf1Q6GQV7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Edrf1Q6GQV7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Edrf1Q6GQV7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Edrf1Q6GQV7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Edrf1Q6GQV7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Edrf1Q6GQV7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Edrf1Q6GQV7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Edrf1Q6GQV7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Edrf1Q6GQV7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Edrf1Q6GQV7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Edrf1Q6GQV7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Edrf1Q6GQV7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Edrf1Q6GQV7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Edrf1Q6GQV7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Edrf1Q6GQV7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Edrf1Q6GQV7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Edrf1Q6GQV7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Edrf1Q6GQV7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms