Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q6DFW0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q6DFW0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q6DFW0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q6DFW0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q6DFW0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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