Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrcc1Q69ZB0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrcc1Q69ZB0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrcc1Q69ZB0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrcc1Q69ZB0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrcc1Q69ZB0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrcc1Q69ZB0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms