Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn2Q68FG2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sptbn2Q68FG2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptbn2Q68FG2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms