Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4fQ66X05 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nlrp4fQ66X05 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlrp4fQ66X05 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms