Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CilpQ66K08 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CilpQ66K08 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CilpQ66K08 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms