Protein–RNA interactions for Protein: Q64524

Hist2h2be, Histone H2B type 2-E, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2beQ64524 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hist2h2beQ64524 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2beQ64524 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms