Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Top2bQ64511 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Top2bQ64511 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Top2bQ64511 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Top2bQ64511 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms