Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Surf4Q64310 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf4Q64310 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf4Q64310 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms