Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Zfp248Q640N4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Zfp248Q640N4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp248Q640N4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Zfp248Q640N4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp248Q640N4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp248Q640N4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp248Q640N4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp248Q640N4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Zfp248Q640N4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp248Q640N4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp248Q640N4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Zfp248Q640N4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Zfp248Q640N4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp248Q640N4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp248Q640N4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Zfp248Q640N4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Zfp248Q640N4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Zfp248Q640N4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Zfp248Q640N4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp248Q640N4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp248Q640N4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp248Q640N4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp248Q640N4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp248Q640N4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp248Q640N4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp248Q640N4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp248Q640N4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp248Q640N4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp248Q640N4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp248Q640N4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp248Q640N4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp248Q640N4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp248Q640N4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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