Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Defa17Q64016 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Defa17Q64016 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Defa17Q64016 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Defa17Q64016 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Defa17Q64016 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Defa17Q64016 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Defa17Q64016 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Defa17Q64016 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Defa17Q64016 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Defa17Q64016 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Defa17Q64016 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Defa17Q64016 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Defa17Q64016 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Defa17Q64016 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Defa17Q64016 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms