Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vil1Q62468 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vil1Q62468 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vil1Q62468 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms