Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Gm20854Q62461 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Gm20854Q62461 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Gm20854Q62461 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gm20854Q62461 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gm20854Q62461 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Gm20854Q62461 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Gm20854Q62461 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Gm20854Q62461 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20854Q62461 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Gm20854Q62461 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Gm20854Q62461 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gm20854Q62461 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Gm20854Q62461 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20854Q62461 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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