Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sp4Q62445 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sp4Q62445 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sp4Q62445 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms