Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl12Q62401 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl12Q62401 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms