Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TrhQ62361 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TrhQ62361 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TrhQ62361 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TrhQ62361 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TrhQ62361 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TrhQ62361 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TrhQ62361 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TrhQ62361 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TrhQ62361 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TrhQ62361 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TrhQ62361 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TrhQ62361 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TrhQ62361 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TrhQ62361 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TrhQ62361 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TrhQ62361 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TrhQ62361 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms