Protein–RNA interactions for Protein: Q62351

Tfrc, Transferrin receptor protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfrcQ62351 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TfrcQ62351 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TfrcQ62351 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TfrcQ62351 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TfrcQ62351 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TfrcQ62351 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TfrcQ62351 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TfrcQ62351 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TfrcQ62351 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TfrcQ62351 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TfrcQ62351 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TfrcQ62351 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TfrcQ62351 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TfrcQ62351 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms