Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim27Q62158 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim27Q62158 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim27Q62158 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim27Q62158 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim27Q62158 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim27Q62158 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim27Q62158 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim27Q62158 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim27Q62158 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim27Q62158 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim27Q62158 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms