Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aldh1a2Q62148 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Aldh1a2Q62148 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Aldh1a2Q62148 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms