Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprrQ62132 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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PtprrQ62132 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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PtprrQ62132 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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PtprrQ62132 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprrQ62132 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtprrQ62132 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtprrQ62132 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
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PtprrQ62132 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprrQ62132 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprrQ62132 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprrQ62132 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprrQ62132 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms