Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf1Q61999 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Odf1Q61999 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms