Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gli3Q61602 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gli3Q61602 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms