Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ecm1Q61508 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ecm1Q61508 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ecm1Q61508 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms