Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccne1Q61457 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccne1Q61457 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccne1Q61457 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms