Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Vsx2Q61412 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vsx2Q61412 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vsx2Q61412 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vsx2Q61412 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vsx2Q61412 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vsx2Q61412 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vsx2Q61412 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vsx2Q61412 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms