Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PcolceQ61398 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PcolceQ61398 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PcolceQ61398 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PcolceQ61398 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PcolceQ61398 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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PcolceQ61398 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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PcolceQ61398 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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PcolceQ61398 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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PcolceQ61398 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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PcolceQ61398 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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PcolceQ61398 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PcolceQ61398 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PcolceQ61398 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PcolceQ61398 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PcolceQ61398 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PcolceQ61398 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PcolceQ61398 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PcolceQ61398 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PcolceQ61398 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PcolceQ61398 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PcolceQ61398 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PcolceQ61398 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PcolceQ61398 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PcolceQ61398 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PcolceQ61398 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PcolceQ61398 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PcolceQ61398 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PcolceQ61398 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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