Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Foxd1Q61345 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Foxd1Q61345 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms