Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc6Q61143 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc6Q61143 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc6Q61143 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms