Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Foxg1Q60987 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxg1Q60987 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms